A játék a híres tévésorozat első évadjával párhuzamos történetet fog elmesélni a főszereplők, pedig Tom Paxton lesz, akit a csúnya gonosz Cég azért küldött, hogy kiderítése miért vonult gyakorlatilag önként börtönbe az eddig törvény tisztelő életet élő Michael Scofield és dobta sutba az építész karrierjét.
A hűvösben töltött időnk során bejárjuk a Fox River ismerős folyosóit miközben a sorozat fontos eseményeinek leszünk a szemtanúi és persze számos kulcsszereplővel is találkozhatunk, ám játékmenet nem csak nézelődésből áll, ugyanis számtalanszor kell lopakodnunk és pörgős akció jelentekben részt vennünk.
